Вода является ключевым фактором экономического развития в Центральноазиатском регионе, однако запасы водных ресурсов распределяются неравномерно и её использование каждой из стран в значительной степени отличается. Государства Центральной Азии, в частности Казахстан, Кыргызстан, Таджикистан, Туркменистан, Узбекистан, а также Афганистан сталкиваются с разногласиями в вопросах водопользования в регионе, которые потенциально могут нести риск возникновения спорных ситуаций и трений.

На этом фоне РЦПДЦА поощряет диалог между странами Центральной Азии по вопросам трансграничного управления водными ресурсами в регионе. В дополнение к этому, Центр оказывает поддержку инициативам, направленным на решение экологических и других проблем, влияющих на ситуацию бассейна Аральского моря, совместно с Международным фондом спасения Арала (МФСА) и другими партнерами. РЦПДЦА также оказывает содействие правительствам в создании потенциала в сфере водной дипломатии и модернизации регионально-правовых рамок по рациональному использованию  трансграничных водных ресурсов в соответствии с международным правом и действующими нормативно- правовыми нормами в бассейне Аральского моря.      

Более того, Центр поощряет  создание странами региональной процедуры /механизма на согласованных и  эффективно реализующихся ключевых принципах международного водного права в бассейне Аральского моря. РЦПДЦА взаимодействует со странами Центральной Азии для повышения осведомленности, связанные с угрозой таяния ледников и изменения климата. Организуются международные семинары в целях необходимости проведения соответствующего анализа направленных на укрепление регионального диалога, исследования ледников и адаптации к изменению климата, с тем чтобы содействовать принятию разумных решений в сфере управления трансграничными водными ресурсами.